More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0997 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  85.43 
 
 		 199 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  82.91 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  73.96 
 
 		 197 aa  314  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  78.65 
 
 		 196 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 		 197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  64.43 
 
 		 197 aa  284  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  60.51 
 
 		 204 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  51 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  51 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  51.79 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  50.78 
 
 		 193 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  53.21 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  57.34 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  52.41 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  42.13 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  48.72 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  48.08 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.71 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  45.35 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  43.3 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  47.53 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  45.68 
 
 		 196 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  45.68 
 
 		 196 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  44 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  46.01 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  45.75 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  44 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  43.29 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  38.34 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  38.34 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40.53 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  35.48 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  43.29 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.88 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  41.83 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  45.04 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  41.83 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  43.05 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  38.36 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.69 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.69 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.69 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.69 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  42.45 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  44.81 
 
 		 181 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.38 
 
 		 204 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  39.75 
 
 		 287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.76 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  44.16 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  44.16 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  44.23 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  47.83 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  45.8 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.72 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  42.21 
 
 		 286 aa  128  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  42.59 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  40.13 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  35.71 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  40.59 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  44.36 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
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NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.71 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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