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for query gene Rfer_1690 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  69.65 
 
 		 203 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  70.65 
 
 		 187 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  70.15 
 
 		 207 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  62.12 
 
 		 210 aa  272  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  65.85 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  63.5 
 
 		 209 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  61.19 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  58.42 
 
 		 204 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  57.22 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  57.39 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  52.6 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  53.65 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  52.43 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  55.11 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  55.68 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  54.55 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  53.59 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  53.59 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  52.27 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  52.25 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  51.26 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  51.26 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  51.26 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  54.44 
 
 		 181 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  51.26 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  51.52 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  53.89 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  53.89 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  52.63 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  53.8 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  49.41 
 
 		 211 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  50.25 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  50.25 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  52.75 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  49.75 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  54.02 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  52.17 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  50.6 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  49.25 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  44.57 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  46.82 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  42.05 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  40.2 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  43.48 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  44.91 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  44.91 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  44.91 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  43.71 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  40.96 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  45.21 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  39.76 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  34.67 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.86 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  34.72 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.5 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  40.48 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  43.7 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.06 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  41.79 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  42.22 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  40.56 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.79 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
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