More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2475 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  46.91 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  44.5 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  41.79 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  47.77 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  42.13 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  47.47 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  48.72 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  48.67 
 
 		 196 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  40.84 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  51.09 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  45.57 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  47.48 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 197 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  42.69 
 
 		 197 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  48.57 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  46.2 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  37.26 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  48.51 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  46.48 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  41.34 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  42.07 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  42.07 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  40.99 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  46.43 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  42.39 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  44.12 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  32.67 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  44.12 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  34.57 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  33.74 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  43.38 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  41.91 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.68 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  34.38 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  31.58 
 
 		 287 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  40 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.44 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  33.12 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30.96 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30.96 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  32.52 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  33.66 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  38.73 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  36.53 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  31.47 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.06 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>