284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3431 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  62.62 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  60.78 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  58.33 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  58.33 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  57.69 
 
 		 210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  49 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  44.83 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  45.96 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  43.5 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  39.43 
 
 		 291 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  41.98 
 
 		 286 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  44.2 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  40.61 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  39.73 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.94 
 
 		 297 aa  121  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  39.08 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.17 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.05 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  34.34 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  42.75 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  36.94 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  31.66 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  35.93 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  34.57 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  45.37 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  38.17 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 187 aa  98.2  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 192 aa  94.4  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.98 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32.69 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  29.14 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  29.14 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  30.3 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  32.74 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  31.1 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  29.25 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  32.56 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  30.49 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>