247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2847 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  38.83 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  38.32 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
200 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 
197 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
226 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 
210 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 
221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 
196 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  34.64 
 
 
197 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  33.54 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  33.54 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  33.93 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.72 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
197 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 
200 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 
200 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  31.5 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  33.76 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 
196 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  29.7 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  29.15 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  31.29 
 
 
286 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  30.49 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.29 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  28.64 
 
 
200 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
199 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  32.1 
 
 
211 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  29.24 
 
 
291 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  32.58 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.15 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.89 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  30.72 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  27.41 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  29.53 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  30.43 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  28.89 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  26.49 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  28.88 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  31.41 
 
 
310 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  30.11 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  29.88 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  30.11 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  30.11 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  30.11 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
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NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  32.09 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  30.99 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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