287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2958 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  86.58 
 
 		 231 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  86.58 
 
 		 231 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  60.78 
 
 		 206 aa  264  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  57.29 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  51.21 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  49.76 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.24 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  40.8 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  34.98 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  41.06 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  33.49 
 
 		 291 aa  121  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  41.04 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  43.38 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.13 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  38.61 
 
 		 171 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.47 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 206 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.33 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  31.84 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 191 aa  95.9  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 		 208 aa  95.5  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.96 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  38.21 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.9 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 197 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  28.42 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  31.14 
 
 		 205 aa  88.6  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.31 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.36 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.73 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  27.5 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  27.5 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 		 706 aa  85.5  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 		 209 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  31.47 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  34.69 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  36.09 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  30.95 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  37.9 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.23 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>