288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1066 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  40.37 
 
 
226 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 
207 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  33.49 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  35.95 
 
 
214 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  38.76 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 
222 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 
187 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.28 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.84 
 
 
203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.17 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 
211 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.03 
 
 
197 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  38.01 
 
 
209 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  39.29 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 
185 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  37.08 
 
 
208 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 
191 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 
204 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  32.14 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 
196 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  38.57 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  31.55 
 
 
213 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 
215 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.16 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  35.67 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  36.24 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 
197 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 
192 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 
197 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  36.69 
 
 
216 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 
206 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.6 
 
 
219 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 
208 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 
210 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 
206 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 
208 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.1 
 
 
291 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 
199 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.17 
 
 
201 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 
199 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 
210 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 
211 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
203 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 
199 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 
196 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 
221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 
206 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 
239 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  32.9 
 
 
196 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 
231 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 
211 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  32.9 
 
 
196 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.47 
 
 
287 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  29.38 
 
 
286 aa  102  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 
197 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 
204 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 
206 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 
221 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 
210 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 
210 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 
211 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  32.65 
 
 
210 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
197 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 
203 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 
198 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 
219 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 
219 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 
197 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 
218 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 
204 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 
206 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
219 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  32.32 
 
 
219 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 
210 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  35.06 
 
 
219 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 
219 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 
216 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 
216 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 
219 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 
196 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>