More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1815 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  43.35 
 
 
208 aa  174  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  52.53 
 
 
200 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  46.58 
 
 
210 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.35 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  44.59 
 
 
210 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 
185 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  44.81 
 
 
215 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  39.11 
 
 
215 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 
204 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  41.61 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  38.1 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40.36 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  43.67 
 
 
213 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  43.61 
 
 
204 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.5 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  42.17 
 
 
204 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  45.07 
 
 
195 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  39.26 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 
198 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  40.29 
 
 
286 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  43.36 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  36.59 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.19 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  36.6 
 
 
171 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 
231 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 
212 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  38.73 
 
 
215 aa  111  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 
205 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 
205 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  41.55 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
205 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
205 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 
197 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.21 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 
202 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  36.42 
 
 
206 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 
203 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 
207 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  38.19 
 
 
180 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 
201 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.74 
 
 
297 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 
201 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 
196 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 
200 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 
197 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 
204 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
220 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
208 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
208 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  32.43 
 
 
198 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 
226 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 
209 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 
205 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 
204 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  36.55 
 
 
287 aa  104  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
219 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
219 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
232 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
232 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
232 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  39.47 
 
 
232 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  36.76 
 
 
185 aa  104  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  37.11 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  38.81 
 
 
185 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 
221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
223 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 
209 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
223 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 
231 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.84 
 
 
201 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  34.57 
 
 
200 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 
197 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 
202 aa  101  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.93 
 
 
198 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0903  SCO1/SenC family protein  29.9 
 
 
185 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.66 
 
 
203 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.26 
 
 
181 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.82 
 
 
218 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>