242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001099 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  100 
 
 
204 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  83.57 
 
 
204 aa  363  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  69.74 
 
 
193 aa  289  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  60.99 
 
 
188 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 
207 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.11 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  46.34 
 
 
210 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
215 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.54 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  38.98 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.29 
 
 
297 aa  89.4  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  36.23 
 
 
185 aa  89.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.23 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  33.77 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  33.62 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  28.28 
 
 
291 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  29.29 
 
 
286 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.32 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  33.6 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.87 
 
 
287 aa  85.5  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  27.32 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.21 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0989  SCO1/SenC family protein  29.38 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.53595  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  31.21 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  30.65 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  36.09 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  32.33 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  32.33 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0919  SCO1/SenC family protein  28.87 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135889  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0903  SCO1/SenC family protein  28.87 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000309759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  35.34 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.17 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.82 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.87 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  35.04 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.06 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  32.84 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  27.32 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  37.07 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.2 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  35.97 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  31.34 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.68 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  28.25 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  36.92 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal 
 
 
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NC_007912  Sde_0045  GGDEF  29.77 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
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NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  27.15 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal 
 
 
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NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  33.9 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
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