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for query gene Sden_3480 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  71.78 
 
 		 212 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  73.63 
 
 		 219 aa  293  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.82 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.89 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  33.69 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.93 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  36.47 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
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NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.1 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.59 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.63 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 187 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
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NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  33.92 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.75 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  28.97 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  28.5 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  35 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.75 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  42.73 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  32.89 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  30.41 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 275 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
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NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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