More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2285 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  96.02 
 
 
201 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  74.63 
 
 
201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  70.59 
 
 
188 aa  297  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  72.28 
 
 
202 aa  287  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  72.28 
 
 
223 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  72.28 
 
 
223 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  71.29 
 
 
202 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  51.76 
 
 
221 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  48.81 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  47.03 
 
 
198 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  42.93 
 
 
207 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  41.09 
 
 
206 aa  157  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.27 
 
 
204 aa  157  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  41.08 
 
 
210 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  43.01 
 
 
209 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 
203 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 
201 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  42.61 
 
 
209 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 
187 aa  151  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  39.77 
 
 
264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 
211 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  41.9 
 
 
201 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 
205 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.43 
 
 
191 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  39.01 
 
 
194 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
205 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
205 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.46 
 
 
181 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  39.16 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  39.08 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 
205 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 
203 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
181 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
181 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.55 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.35 
 
 
213 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.25 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.22 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.51 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.59 
 
 
197 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 
197 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 
219 aa  121  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  44.7 
 
 
197 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.39 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  44.36 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.48 
 
 
197 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  40.77 
 
 
197 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
211 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 
221 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.95 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 
220 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
215 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 
211 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 
196 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
211 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
208 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 
197 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 
209 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.73 
 
 
197 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 
208 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 
208 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  32.81 
 
 
219 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39.26 
 
 
203 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 
197 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  30.46 
 
 
202 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 
197 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  30.46 
 
 
197 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  35.1 
 
 
200 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
219 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
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NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 
275 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 
217 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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