More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1038 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 217 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  99.08 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  91.94 
 
 		 211 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  91.94 
 
 		 211 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  91.94 
 
 		 226 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  91.94 
 
 		 211 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  91 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  71.43 
 
 		 204 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 219 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 219 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  78.87 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  77.32 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  68.57 
 
 		 219 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  73.71 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  48.15 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  45.41 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  39.88 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  45.03 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.54 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.02 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  38.42 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.16 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  32.29 
 
 		 196 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.67 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.67 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.51 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  30.73 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.56 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.5 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  35.5 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  46.51 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  44.19 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.68 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.16 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 193 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  44.78 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.1 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  38.06 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.18 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
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NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
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NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
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NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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