More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1844 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  46.19 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 207 aa  130  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  38.06 
 
 		 232 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.66 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  36.77 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  35.94 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  35.94 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  35.94 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.35 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  35.94 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  35.94 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  37.64 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.22 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 205 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.54 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 275 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 217 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.16 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 215 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  32.88 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  34.53 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.67 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  34.46 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  39.06 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  35.4 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 205 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.29 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
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