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for query gene Mrub_2625 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  72.88 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  45.91 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  45.91 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  43.21 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  45 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  46.11 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  45.34 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.05 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.75 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  46.88 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  46.25 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  46.5 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  44.87 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  43.83 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  42.77 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  42.5 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  45.89 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.68 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  44.76 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.68 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  43.4 
 
 		 197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  41.61 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.76 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  43.75 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  43.75 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  43.12 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  44.83 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  44.83 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  38.74 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  44.97 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  42.18 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  42.18 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  42.18 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  45.64 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  39.06 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  42.77 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  41.55 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  41.55 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  42.75 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  43.66 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.47 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  35.94 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  42.66 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  37.5 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  35.94 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.23 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  38.33 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  36.94 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
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NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
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