More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3419 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
196 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  95.41 
 
 
226 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  94.9 
 
 
200 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 
193 aa  277  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  69.51 
 
 
197 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  64.09 
 
 
197 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  55.56 
 
 
204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  52.82 
 
 
197 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  51.04 
 
 
197 aa  201  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  51.79 
 
 
199 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  53.97 
 
 
199 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  51.32 
 
 
199 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  55.9 
 
 
196 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  55.03 
 
 
206 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  47.21 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  46.56 
 
 
197 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  49.69 
 
 
197 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  53.5 
 
 
221 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  46.96 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  48.97 
 
 
196 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  48.97 
 
 
196 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  42.29 
 
 
215 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  42.29 
 
 
215 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  49.65 
 
 
200 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  45.95 
 
 
199 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  48.94 
 
 
196 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  45.56 
 
 
200 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  41.71 
 
 
211 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  48.67 
 
 
208 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  46.29 
 
 
203 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  43.85 
 
 
197 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  37.81 
 
 
210 aa  144  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 
200 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 
200 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  43.79 
 
 
219 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  44.37 
 
 
198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  38.12 
 
 
192 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 
210 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  45.26 
 
 
215 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  50.4 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  41.11 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  49.6 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  49.6 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  47.45 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  50.36 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  50.4 
 
 
206 aa  131  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  44.29 
 
 
191 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.07 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 
210 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  45.32 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  48 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  46.04 
 
 
203 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  45.8 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  45.99 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  42.34 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  37.27 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  44.97 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  45.32 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  40.44 
 
 
205 aa  125  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  43.8 
 
 
206 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  47.1 
 
 
205 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 
191 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 
205 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  46.1 
 
 
204 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  43.07 
 
 
206 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.52 
 
 
204 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  46.48 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.65 
 
 
205 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 
205 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  35.8 
 
 
297 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 
200 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 
201 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  40 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  39.13 
 
 
286 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 
202 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  47.01 
 
 
214 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  45.26 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  44.53 
 
 
205 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  44.53 
 
 
205 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  44.53 
 
 
205 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  44.53 
 
 
205 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  44.53 
 
 
205 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 
202 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  44.93 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 
211 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>