More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3662 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  49.47 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  49.24 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  46.46 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  46.97 
 
 		 197 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  49.36 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  46.46 
 
 		 197 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  47.21 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  51.28 
 
 		 196 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  44.1 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  51.95 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  44.67 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  48.08 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  46.15 
 
 		 199 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  53.9 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  40.64 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  48.28 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  40.64 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  41.46 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  41.46 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  47.26 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.04 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  39.63 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  40.13 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  40.61 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.41 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  42.77 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  43.88 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  39.26 
 
 		 287 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  45.32 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 191 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.57 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  44.53 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  42.04 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  42.04 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.37 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  40.28 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.87 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.89 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  32.49 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.43 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  38.41 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.35 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  35.19 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  33.17 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  40.67 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  34.24 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 181 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  42.06 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  39.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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