263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0096 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 193 aa  399  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  69.74 
 
 		 204 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  69.23 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  61.68 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.23 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  35.82 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  41.53 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 224 aa  97.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  35.77 
 
 		 297 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  31.35 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  34.51 
 
 		 291 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  31.46 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 211 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  34.68 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.06 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.6 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  29.89 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  31.29 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.95 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  37.82 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.6 
 
 		 287 aa  89  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  33.33 
 
 		 286 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0903  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.39 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.5 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0989  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.53595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  30.65 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  33.81 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.84 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  27.32 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  29.68 
 
 		 180 aa  84.7  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  33.87 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  27.69 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  32.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  27.69 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  33.33 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>