More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2979 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  54.01 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  49.71 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  47.52 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  41.11 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  40.22 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  47.18 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  40.22 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  44.6 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  43.62 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  44.2 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  40 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.45 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  41.06 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  40.97 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  36.07 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  39.72 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  39.89 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  38.1 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  39.78 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  37.95 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  41.43 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.43 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  40.72 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.26 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.28 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  34.71 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.76 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  37.08 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.32 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  39.61 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.41 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  36.96 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.76 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  40.71 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  42.25 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.11 
 
 		 297 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 		 194 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  34.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.75 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  34.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  34.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  34.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  34.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.04 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  34.75 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>