More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7627 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  41.12 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  46.79 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  46.91 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  46.91 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  37.95 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  41.46 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  45.51 
 
 		 196 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  37.38 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  38.22 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.94 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  37.95 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  43.79 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  41.55 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  42.6 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  42.6 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  44.88 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.32 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.32 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  36.46 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  44.54 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  36.98 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  36.98 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.04 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.73 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  30.9 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  34.12 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  34.12 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  34.12 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  34.12 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  34.12 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  27.04 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.96 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.96 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.96 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  31.49 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.96 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>