More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1992 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  55.38 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  53.61 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  54.08 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  56.9 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  56.9 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  51.01 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  56.32 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  53.5 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  44.67 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  48.78 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  44.97 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  46.95 
 
 		 197 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  51.75 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  48.72 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  48.08 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  48.43 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  41.12 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  47.47 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  47.77 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  47.1 
 
 		 196 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  46.91 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  42.41 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  36.92 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  40.61 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  40.61 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  43.95 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  43.01 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  43.09 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  41.36 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.01 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.06 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  43.38 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  41.29 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.6 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  41.91 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  39.88 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  41.04 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.65 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  36.65 
 
 		 297 aa  121  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  41.09 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.59 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 205 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 205 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  39.75 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.51 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  31.44 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.4 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>