More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0721 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  78.65 
 
 		 197 aa  327  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  75.13 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  72.25 
 
 		 197 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  78.65 
 
 		 199 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  77.84 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  75.92 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  57.29 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 200 aa  198  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  51.32 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  54.27 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  57.62 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  51.28 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  49.74 
 
 		 193 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  54.29 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  44.51 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  40.93 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  47.17 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  47.1 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  47.62 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  46.06 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.49 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  44.94 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  44.94 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  44.3 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.03 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  47.45 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  37.91 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 203 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  50.34 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  47.24 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  44.24 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  43.64 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  46.76 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  42.42 
 
 		 231 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  48.97 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  45.32 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  46.63 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  48.97 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  41.29 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  48.28 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  43.35 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  43.88 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  43.35 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  44.24 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  41.82 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  43.24 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  35.76 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  42.24 
 
 		 286 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  33.33 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  41.77 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  42.75 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.99 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  41.13 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  42.66 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  41.06 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  37.89 
 
 		 287 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  38.32 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  40.67 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  40.97 
 
 		 264 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>