More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4443 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  44.67 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  41.38 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  47.06 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  47.06 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  42.44 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.32 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  44.44 
 
 		 196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  46.45 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  46.45 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  47.06 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  46.01 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  40.62 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.21 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  43.51 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  37.38 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.12 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.51 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.81 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  41.98 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  37.26 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.19 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.13 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.13 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  39.75 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  37.13 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  40.61 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  38.71 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.16 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  38.32 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.41 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  45.38 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  43.94 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  44.2 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  38.06 
 
 		 287 aa  111  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  47.79 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.89 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  39.85 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  43.18 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  42.75 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.28 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.91 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  33.52 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  37.86 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  35.15 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.34 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  35.95 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  41.91 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
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