More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2858 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  69.04 
 
 		 200 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  66.5 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  64.32 
 
 		 199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  61.18 
 
 		 196 aa  230  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  61.18 
 
 		 196 aa  230  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  58.58 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  51.01 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  44.9 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  44.04 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  44.56 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  46.79 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  46.11 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  42.44 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  47.17 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  45.68 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  47.03 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  44.91 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  44.5 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  47.03 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  45.95 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  43.83 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  38.83 
 
 		 215 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 215 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  44.38 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  37.77 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  41.1 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  45.27 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  40.36 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  39.16 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  40.76 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.04 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  33.16 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 209 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.84 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.6 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.01 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.82 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.85 
 
 		 287 aa  117  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.53 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.12 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.57 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  33.72 
 
 		 286 aa  111  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.93 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  36.23 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  31.65 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  31.65 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  32.14 
 
 		 171 aa  101  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  31.65 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  31.65 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>