More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0210 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  84.77 
 
 
197 aa  349  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  71.07 
 
 
197 aa  307  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  75.13 
 
 
196 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  69.79 
 
 
199 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  71.88 
 
 
199 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  69.59 
 
 
199 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  54.04 
 
 
204 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  46.97 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  46.56 
 
 
196 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  45.5 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  49.7 
 
 
197 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  45.5 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  46.88 
 
 
193 aa  175  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  46.95 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  51.63 
 
 
197 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  52.94 
 
 
221 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  41.21 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  41.24 
 
 
215 aa  161  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 
215 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 
211 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  44.3 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  44.3 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  43.83 
 
 
199 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  43.67 
 
 
196 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 
200 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40.82 
 
 
203 aa  151  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
199 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 
200 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  42.69 
 
 
208 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  39.18 
 
 
210 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  48.2 
 
 
206 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  40.7 
 
 
203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  46.76 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  44.38 
 
 
205 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
196 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  44.38 
 
 
205 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 
205 aa  138  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  44.38 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  43.79 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  46.04 
 
 
198 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 
231 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 
210 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 
204 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  44.03 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.67 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 
221 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  42.77 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  37.13 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.83 
 
 
201 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  38.27 
 
 
192 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  41.14 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  46.04 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.16 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.76 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.16 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.16 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.16 
 
 
205 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.51 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.51 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  36.46 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.32 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.83 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 
191 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  39.33 
 
 
210 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 
205 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 
197 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 
197 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  44.78 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  40.91 
 
 
286 aa  122  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.77 
 
 
197 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  43.7 
 
 
201 aa  121  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 
264 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.7 
 
 
211 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 
192 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  41.46 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 
217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 
208 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
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