281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1138 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0903  SCO1/SenC family protein  54.55 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000309759  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0989  SCO1/SenC family protein  55.03 
 
 
186 aa  195  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.53595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0919  SCO1/SenC family protein  54.5 
 
 
186 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  41.76 
 
 
185 aa  147  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  41.49 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  43.18 
 
 
180 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
207 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
200 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
205 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
181 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 
181 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.92 
 
 
181 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.97 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 
204 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 
198 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.29 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 
194 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 
205 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  33.58 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  37.82 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  36.23 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
275 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
217 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
217 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  35.56 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.29 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
226 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  32.84 
 
 
200 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 
185 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 
219 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  34.78 
 
 
286 aa  85.5  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 
202 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  36.57 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.62 
 
 
218 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  32.31 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  35.88 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
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NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
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