292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0109 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  51.68 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  49.66 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  41.48 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  45.3 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  40.59 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  41.54 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  46.67 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  41.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  41.44 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  41.44 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  53.38 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  46.45 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  41.99 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  41.99 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  40.1 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  39.36 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.87 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  38.46 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  42.58 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  41.57 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  37.57 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.76 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  33.15 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  40.69 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  38.19 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  46.4 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  34.9 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  38.99 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  33.56 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  30.64 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  32.68 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.71 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  28.04 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  31.41 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  28.35 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1221  SCO1/SenC family protein  33.15 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 221 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 247 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  37.3 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 275 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.3 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.13 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.56 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>