288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3525 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  51.43 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  51.43 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  51.18 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  51.2 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  55.43 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  47.87 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  46.01 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  50.75 
 
 		 214 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  51.64 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  44.83 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  40.53 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  48.32 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  45.56 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  40.22 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  43.45 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.46 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  37.32 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  35.43 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.37 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  35.37 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  27.4 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.91 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.48 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  30.39 
 
 		 287 aa  92.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  34.01 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 191 aa  92  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  30.68 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  29.31 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  35.52 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.26 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.56 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.48 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.11 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  34.11 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.11 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  32.35 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.03 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  34.66 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
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NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.35 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.35 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  39.84 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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