279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0249 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 		 217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  56.86 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  56.86 
 
 		 210 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  56.86 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  56.86 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  54.41 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  60.44 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  53.92 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  53.2 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  54.41 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  56.85 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  50.98 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  51.76 
 
 		 211 aa  207  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  45.71 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  40 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  38.67 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.49 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.52 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  32.96 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  36.84 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  32.04 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  34.15 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  33.54 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.09 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  29.53 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.48 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.6 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.99 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  38.81 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  25.96 
 
 		 287 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  34.48 
 
 		 310 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  32.17 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  30.26 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  29.82 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  42.19 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  28.71 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.35 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.41 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  43.37 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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