More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0189 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  67.61 
 
 
214 aa  310  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  59.53 
 
 
209 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 
210 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 
210 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  52.58 
 
 
210 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  52.09 
 
 
210 aa  237  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  51.4 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  57.73 
 
 
211 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  51.4 
 
 
219 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  52.11 
 
 
213 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 
219 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  57.3 
 
 
210 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  55.33 
 
 
211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  50.98 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  46.01 
 
 
217 aa  208  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  42.53 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  41.48 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  37.28 
 
 
222 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  41.53 
 
 
212 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  41.04 
 
 
226 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  34.82 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 
211 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  38.12 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  37.28 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 
211 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.41 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  35.39 
 
 
216 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  37.41 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.98 
 
 
219 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
204 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 
210 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  30.81 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 
210 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  30.73 
 
 
200 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  34.64 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
211 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 
197 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
197 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  42.42 
 
 
231 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 
208 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 
203 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 
192 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 
191 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 
203 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.57 
 
 
221 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 
213 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.86 
 
 
200 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 
224 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 
221 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  36.23 
 
 
197 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.69 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.85 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.49 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  42.11 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  31.96 
 
 
287 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  34.75 
 
 
291 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
181 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  30.12 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.8 
 
 
196 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
181 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.91 
 
 
205 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  30.12 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 
205 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.15 
 
 
181 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  30 
 
 
286 aa  91.3  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  31.28 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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