219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1301 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  63.08 
 
 
220 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  52.82 
 
 
210 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  46.41 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  46.63 
 
 
217 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  46.38 
 
 
213 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  39.9 
 
 
221 aa  158  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  36.82 
 
 
210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 
236 aa  151  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  45.06 
 
 
228 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  37.97 
 
 
223 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  35.98 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  37.63 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  37.28 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 
228 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  30.13 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.77 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  30.13 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  30.13 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  30.13 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  30.13 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.94 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.75 
 
 
195 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.94 
 
 
195 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.52 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  24.43 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
193 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  25.11 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  28.19 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 
356 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  25.3 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  26.04 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  32.54 
 
 
186 aa  58.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  27.44 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  26.19 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  28.22 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  25.52 
 
 
283 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.09 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  24.55 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  26.63 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  26.97 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  26.63 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  23.45 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  26.63 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  26.63 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  25.34 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 
363 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  28.06 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  33.01 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.19 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  23.74 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
327 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  22.49 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  32.67 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  33.7 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  27.78 
 
 
204 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 
210 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
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