81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2128 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  73.15 
 
 		 227 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  40.56 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  38.28 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  35.53 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.9 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  25.75 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  25.66 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  26.04 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  27.64 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  28.69 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.75 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  37.07 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.08 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  41.27 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.1 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0482  hypothetical protein  33.96 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30.89 
 
 		 425 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  29.51 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  31.37 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  28.09 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  39.06 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  21.65 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  26.97 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  21.94 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  33.8 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  33.8 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.28 
 
 		 626 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.35 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  24.83 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  27.42 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  29.1 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  24.79 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  29.1 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  25.89 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  30.7 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  26.44 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 		 217 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 208 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  32.2 
 
 		 197 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>