269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2665 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  45.86 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  38.83 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  42.51 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  39.07 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  39.13 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  34.78 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  33.75 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  32.05 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 		 291 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 282 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.62 
 
 		 626 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.97 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.28 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  30.66 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.03 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  32.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  28.27 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  30.15 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  29.73 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  30.15 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  30.15 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  29.91 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  29.41 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  29.41 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  29.41 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  29.41 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  29.1 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  24.19 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.73 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  32.03 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  27.14 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  27.32 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  28.17 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  32.81 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  26.57 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  29.22 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  29.2 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  35.05 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  26.04 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  33.64 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>