289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2710 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  45.86 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  42.39 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  35.98 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  38.51 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  41.18 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  39.66 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  29.34 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  33.75 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  28.57 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.14 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  31.58 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  31.14 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  31.14 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.08 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  28.75 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  30.54 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.23 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  30.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  30.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  30.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  30.54 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.2 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  25.9 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  27.91 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.81 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  24.04 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  34.4 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  25.36 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  24.32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  24.32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  24.32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  24.32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  24.32 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  33.94 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  23.57 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  29.11 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  22.6 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  23.65 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  23.65 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  24.67 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  23.65 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  28.17 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  32.14 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  23.65 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  23.74 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25.77 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  28.39 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  27.49 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  22.08 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  28.42 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  25.97 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  25.24 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>