More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4017 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  84.57 
 
 		 194 aa  287  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  66.46 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  66.46 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  65.84 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  65.84 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  65.84 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  65.84 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  65.22 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  65.22 
 
 		 209 aa  223  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  39.31 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  26.35 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  27.85 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  29.94 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  28.37 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.4 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.86 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.22 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  27.84 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.95 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  32.17 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  28.28 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.76 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.68 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  29.49 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  24.11 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  28.11 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  27.56 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  30.77 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  31.87 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  26.54 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  29.55 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  26.28 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  29.55 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.65 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35.24 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.47 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.47 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  29.67 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>