250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2416 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 
202 aa  138  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  26.75 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  27.85 
 
 
204 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  27.22 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.85 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  29.55 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  27.17 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.79 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  27.18 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  26.7 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  32.04 
 
 
444 aa  68.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  26.63 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  20.69 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  25.91 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  34.17 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  25.34 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  26.57 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  31.51 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  32.67 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  24.37 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  24.05 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  33.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  37.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  37.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  37.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  37.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  37.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  24.24 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  24.24 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  24.44 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  23.48 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  24.24 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  23.48 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  24.24 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  25.55 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  25.55 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  24.69 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  25.61 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.04 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.96 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  31.03 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.11 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  26.35 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  24.16 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 
363 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  25.71 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  25.36 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  26.85 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  28.09 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 
356 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 
240 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  23.08 
 
 
243 aa  55.1  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>