More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0216 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  100 
 
 		 444 aa  917    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  47.48 
 
 		 147 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  43.7 
 
 		 180 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  41.55 
 
 		 187 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  39.19 
 
 		 180 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  37.66 
 
 		 190 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  40.69 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  39.26 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 240 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  37.16 
 
 		 181 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  45.45 
 
 		 155 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  37.32 
 
 		 179 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  37.68 
 
 		 180 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  37.68 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  37.68 
 
 		 180 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  37.68 
 
 		 180 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 217 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  32 
 
 		 243 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 228 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 188 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  44.44 
 
 		 142 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 236 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  43.75 
 
 		 142 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  34.15 
 
 		 195 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  35.71 
 
 		 195 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  35.71 
 
 		 195 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 		 210 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 217 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.54 
 
 		 195 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  35.71 
 
 		 195 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  33.54 
 
 		 195 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  33.54 
 
 		 195 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  33.54 
 
 		 195 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  33.54 
 
 		 195 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 195 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 210 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  27.87 
 
 		 213 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.68 
 
 		 223 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 		 220 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 248 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  41.23 
 
 		 190 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 202 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  30.57 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  39.42 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  27.71 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.03 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.13 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  31.62 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  30.46 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  30.59 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  31.18 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.13 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.22 
 
 		 194 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.88 
 
 		 197 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 193 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  30.77 
 
 		 151 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  30.29 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  26.38 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.62 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  32.04 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  37.11 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.82 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  31.48 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  27.04 
 
 		 204 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  26.42 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>