235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1978 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  66.35 
 
 		 221 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  66.82 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  66.35 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  65.88 
 
 		 221 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  55.06 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  38.62 
 
 		 363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  35.23 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 425 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 340 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.51 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 356 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  34.39 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  34.39 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  28.43 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  42.39 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.38 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  33.79 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  26.32 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  41.77 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  34.41 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  35.04 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  37.84 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  37.62 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  34.57 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  29.91 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  32.81 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  29.83 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  36.7 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  36.46 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  28.8 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  33.62 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.24 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.35 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.82 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.24 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  41.11 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  28.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  28.86 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  36 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  28.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.69 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.21 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  33.02 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  30.69 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  24.43 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.34 
 
 		 626 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  29.56 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  32.63 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.46 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.89 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>