More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0517 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 228 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  40.22 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  36.24 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  40.83 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  33.8 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  33.89 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  32.2 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  26.94 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  32.53 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  33.56 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  32.05 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  32.05 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  31.41 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  37.62 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.19 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  39.76 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  35.35 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  29.79 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  36.17 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.46 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  28.25 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  29.66 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  30.66 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  28.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.4 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  31.62 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  27.43 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  30.13 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  37.35 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  29.09 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  29.48 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 327 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  32.58 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  25.69 
 
 		 195 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  26.39 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  30.7 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  26.49 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  30.7 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
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NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  33.61 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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