More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1588 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  75.4 
 
 		 190 aa  290  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  56.19 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  56.19 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  56.19 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  56.7 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  56.19 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  56.19 
 
 		 195 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  55.67 
 
 		 195 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  55.67 
 
 		 195 aa  229  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  56.99 
 
 		 194 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  55.15 
 
 		 195 aa  227  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  55.15 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  32.95 
 
 		 223 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  34.5 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  33.33 
 
 		 444 aa  98.6  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 240 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  30.96 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  37.04 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  35.46 
 
 		 243 aa  88.2  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 210 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  30.59 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  27.65 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 275 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  35.4 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  28.93 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  29.85 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  30.43 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  41.05 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  28.15 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  31.36 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  36.47 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  33.55 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.15 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  28.79 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  26.09 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  30.82 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  25.86 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.16 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  32.77 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  32.9 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
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