More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2583 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
190 aa  393  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  75.4 
 
 
188 aa  295  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  55.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  55.91 
 
 
194 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  55.61 
 
 
195 aa  218  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  55.61 
 
 
195 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  55.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  55.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  55.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  55.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  55.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  54.55 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  54.55 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  37.67 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 
240 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 
221 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 
236 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  34.52 
 
 
223 aa  89.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  32.16 
 
 
223 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  36.17 
 
 
243 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  41.23 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 
296 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  29.3 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.08 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5146  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  29.65 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  30.27 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  23.79 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  33.33 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  38.14 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.63 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  28.37 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  35.19 
 
 
287 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  39 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.68 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 
204 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  29.23 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  25.97 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.95 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  30.37 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  26.01 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  26.18 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.21 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 
248 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
282 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  31.4 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  29.12 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 
356 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
363 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  28.81 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
202 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
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NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
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