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for query gene Oter_1801 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  44.49 
 
 
283 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  34.98 
 
 
282 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 
240 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 
208 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 
204 aa  85.5  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
228 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 
193 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 
228 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.01 
 
 
626 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  33.03 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.07 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.85 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  29.33 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  39.06 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 
190 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  38.98 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  27.71 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.1 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  37.25 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  32.88 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 
203 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  29.56 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
203 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
187 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  27.7 
 
 
223 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.18 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 
204 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.38 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  30.4 
 
 
197 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
221 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.57 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.57 
 
 
195 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
205 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
221 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
205 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.82 
 
 
203 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  28.57 
 
 
195 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  31.29 
 
 
219 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 
209 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 
207 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  29.14 
 
 
193 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 
210 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 
199 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 
194 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 
222 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  26.76 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  30.52 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
197 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  27.89 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 
205 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  32.77 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  28.18 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 
205 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 
219 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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