More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1482 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  67.65 
 
 		 193 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  44.3 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  43.05 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 425 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.93 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  38.92 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 363 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  33.9 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  36.79 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  37.62 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.87 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  31.68 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  30.51 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  39.09 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.76 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  34 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  29.63 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  29.5 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  29.5 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  29.86 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  30.56 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  33.8 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  27.78 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  26.39 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.61 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  32.11 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  27.08 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  27.35 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  27.15 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.73 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>