258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1125 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 247 aa  470  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  69.64 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  43.66 
 
 		 626 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  38.73 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  33.89 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  32.21 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  26.25 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.91 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 		 425 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.91 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  27.64 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  31.29 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.37 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.12 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  30.47 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  26.03 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  26.83 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  27.34 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  25.73 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  25.32 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  41.86 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1503  hypothetical protein  30.54 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.522768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  29.66 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  28.82 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  26.97 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  27.15 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  26 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  26.12 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  34.88 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  28.67 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  26.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  26.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  30.39 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  24.26 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  25.5 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  25.77 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  24.82 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  27.66 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  27.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  27.56 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  30.07 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  23 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  24.82 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  26.19 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>