94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4124 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  55.81 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  35.53 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  34.65 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  34.22 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  32.07 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  34.39 
 
 		 182 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  40.23 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  29.55 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  37.78 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  29.27 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  22.49 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  27.66 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  23.27 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.01 
 
 		 626 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  30.07 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  24 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  25.6 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.17 
 
 		 444 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  26.55 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  26.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  26.53 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  23.61 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  23.57 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  23.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  23.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  23.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  23.57 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  23.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  23.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  23.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  24.44 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  23.24 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  23.77 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  25.53 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  26.15 
 
 		 327 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  26.15 
 
 		 327 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  38.81 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  26.15 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  28.38 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  28.15 
 
 		 363 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  28.78 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  22.96 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.1 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.72 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  25.48 
 
 		 231 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  25.42 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  25.42 
 
 		 204 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 236 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>