28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1503 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1503  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1083    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.522768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2165  transmembrane protein  38.76 
 
 		 390 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0585637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  27.82 
 
 		 291 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  27.48 
 
 		 232 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  26.23 
 
 		 206 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 		 363 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  24.5 
 
 		 626 aa  47.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.03 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  30.57 
 
 		 209 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  28.95 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  34.83 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  24.71 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 222 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 340 aa  43.9  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  30.38 
 
 		 204 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>