146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2964 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2964  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  39.44 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1631  electron transport protein SCO1/SenC  41.63 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3710  electron transport protein SCO1/SenC  37.9 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3059  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5225  Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems- like protein  29.32 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.39 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  32.52 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  31.71 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  37.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  30.07 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1503  hypothetical protein  28.28 
 
 		 549 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.522768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  28.23 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  31.3 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  26.21 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  24.22 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  25.73 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  24.72 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  23.57 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  28.23 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  25.88 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  26.75 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  29.11 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.16 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  24.22 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  24.32 
 
 		 444 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.49 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  22.29 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  25.43 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  23.29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  24.14 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  22.29 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  22.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  22.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  22.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  22.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  22.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  22.9 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  22.76 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  29.66 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  27.49 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  29.6 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  25.23 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  26.9 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  24.31 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  31.63 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  26.22 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  21.7 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  23.97 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  25 
 
 		 626 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  22.79 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  22.79 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  26.98 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  26.9 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  28.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  28.42 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>