More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0582 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.34 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.05 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.79 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.97 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.29 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.2 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  40.28 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  38.06 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.05 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  34.81 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  29.31 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  34.74 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  29.15 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2235  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  36.23 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.65 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.59 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  38.06 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.88 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  35.71 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  30.85 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.66 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  30.35 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  39.01 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  27.6 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>