More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2283 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  98.62 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  91.74 
 
 		 218 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  88.53 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  64.38 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  43.75 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  39.75 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 		 363 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  35.44 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 425 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 327 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 327 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  30.95 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  32.58 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.1 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 356 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 340 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  26.84 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  27.45 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  31.39 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  39.73 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  27.94 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  32.99 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  32.71 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.61 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  30.14 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  38.03 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  29.41 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  33.83 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.67 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  26.4 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  41.33 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  24.88 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.31 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.56 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  36.78 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  28.7 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  28.7 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  27.07 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  30.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>