58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1066 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  30.63 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  26.26 
 
 		 327 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29.32 
 
 		 327 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  29.32 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  25.16 
 
 		 425 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  27.07 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  29.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  29.27 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  25.4 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  29.22 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  31.65 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  27.52 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  26.12 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  24.37 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  25.37 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  30.66 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  23.94 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  29.93 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  25.81 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  25.81 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  27.5 
 
 		 245 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  26.71 
 
 		 230 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  26.55 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>