148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0070 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 		 327 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  41.72 
 
 		 327 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 327 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 363 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 340 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 		 356 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  44.25 
 
 		 228 aa  98.6  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 425 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  39.39 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  35.48 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 222 aa  94.4  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.39 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.59 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  35.65 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.62 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  30.16 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  35.65 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  28.7 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 296 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  29.14 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  27.63 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  25.9 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.79 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.79 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.79 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.22 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.16 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  25.55 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.52 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  31.39 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  32.58 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  27.86 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.39 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  28.68 
 
 		 444 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  24.53 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  32.38 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  31.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  25.64 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  31.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  31.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  25.9 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  26.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  26.14 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  24.36 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  28.44 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  24.36 
 
 		 276 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  27.14 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  24.81 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  30.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  30.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  30.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  26.43 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  30.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  27.89 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  27.16 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  25.51 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  27.34 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  33.02 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  28.57 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  23.26 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  25.86 
 
 		 344 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  27.78 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>